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经济师
siRNA 是合成的,从公司买回来,可以直接用于短暂性的转染,用完就没有了。优点是迅速便利。
shRNA 是根据质粒的。需自己克隆,也有公司卖不过较自己克隆要贵得多。
因为是质粒,故此,可以没有任何要求和限制的扩增,不会有用完的一天。
质粒的转染效率跟siRNA类似,不过shRNA被表达出来需时间,故此,效果可能没有siRNA直接迅速。
但是,shRNA质粒大多数情况下含有抗生素选择基因,这个问题就允许你筛选稳定细胞系,不过这个很花时间(1-3个月)
不过但凡是稳定细胞系筛选成功,你就再不需要做转染实验了,一劳永逸。
故此,两者各带来一定长,要看你的实验性质。
假设只是补个数据,果断用siRNA。假设建立起稳定细胞体系以后还有不少实验,建议用shRNA,
医学科研中易混淆的概念解释之siRNA篇:
1 siRNA和shRNA,虽然都是干扰RNA类型,但是,siRNA和shRNA却有着天壤之别。siRNA是单链RNA干扰,通过结合mRNA,阻止蛋白的表达。shRNA实际上是一类病毒,整合至基因组中进行基因干扰。因为这个原因siRNA和shRNA的最大区别就在于是不是整合进入了基因组中还有转染有效性的长短。两者在转染效率上目前已经没有特定的差别。
2 通路阻断剂和siRNA当中的区别。有部分实验会使用通路阻断剂,比如akt通路阻断剂
LY294002,有部分老师也会使用siRNA来阻断Akt的激活。两者当中有哪些区别?最大的区别在于阻断剂是影响蛋白的活性(比如乙酰化、磷酸化和泛素化激活等);而siRNA是直接降低蛋白的表达。因为这个原因,在细胞需某些蛋白时,最好的方法是为了让用阻断剂而不是用siRNA ,因为蛋白表达下降不出意外的情况大概会导致额外的阳性结果产生。
3 siRNA和非编码RNA。siRNA不属于非编码RNA类型是属于和mRNA具有互补作用的RNA单链。并不是编码RNA是细胞内没有基因编辑功能的RNA总称。siRNA可能会影响非编码RNA的稳定,并不是编码RNA是没办法通过siRNA进行抑制和下调的。
需要在细胞对数生长时间以前转染可以提升效率。然后试一下质粒或者慢病毒的浓度,还有转染剂的浓度,可在预实验用空白对照做一个梯度分析。荧光实在看不出来可以用western检测,考生学员这么试过,发现蛋白表达量还是有差距的
多胺和新一代转染介质: 多胺实际上也是氨基多聚物, 原理无非根据吸附带负电的核酸形成非 共价结合的复合物,结合并穿越同样带负电的细胞膜。
瞬时转染是指将构建好的质粒通过某种方法导入到哺乳动物细胞内(主要指HEK293细胞),该质粒上的外源基因不整合到细胞自己的基因组上…
细胞转染实验:
目标:学习和掌握并熟悉外源基因导入真核细胞的主要方式—脂质体介导的转染。了解外源基因进入的大多数情况下性方式,观 测外源蛋白的表达(绿色荧光蛋白),为染色准备实验材料。
原理:外源基因进入细胞主要有四种方式:电击法、磷酸钙法、脂质体介导法和病毒介导法。电击法是在细胞上短时间暂时性的穿孔让外源质粒进入;磷酸钙法和脂质体法是利用不一样的载体物质带上质粒通过直接穿膜或者膜融合的方式让外源基因进入细胞;病毒法是利用包装了外源基因的病毒感染细胞的方式让其进入细胞。
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